"Es ist klar, dass sich die Menschen dafür entschieden haben, Kurs zu halten", sagte Joseph Muscat im staatlichen Fernsehen nach der Auszählung erster Stimmen am Sonntag.
Sein Herausforderer Simon Busuttil von der konservativen Nationalist Party räumte seine Niederlage ein. Die offiziellen Ergebnisse werden erst im Laufe des Sonntags erwartet.
Den Wahlkampf hatte eine Korruptionsaffäre überschattet, die im Zusammenhang mit dem "Panama Papers"-Skandal stand. Dabei wurde auch Muscats Frau vorgeworfen, eine geheime Offshore-Firma in Panama zu haben. Muscat hatte die Wahlen wegen der Vorwürfe ausgerufen - rund ein Jahr vor dem regulären Ende des Legislaturperiode. Malta ist das kleinste EU-Land und hat noch bis Ende Juni die EU-Ratspräsidentschaft inne.